Trong giai đoạn 2002 – 2011, dựa trên ứng dụng các phương pháp truyền thống và hiện đại, kết hợp với chọn lọc từ nguồn gen trong và ngoài nước, nhóm tác giả nghiên cứu Viện Nghiên cứu Rau quả đã chọn tạo được hơn 20 giống hoa mới, tiêu biểu là: giống loa kèn Tứ Quý; các giống lay ơn DDL1, lay ơn Đỏ 09; các giống cúc CN07-06, CM-03; các giống đồng tiền Piton, Sawana; các giống hoa hồng VR2, VR4; các giống lily Sorbonne, Acapulo, Belladonna; các giống lan Hồ Điệp Ban Mai Hồng, Tiểu Kiều Tím; các giống Hồng môn HMC02, HMC04; các giống thược dược lùn TDL-03, TDL-05; và nhiều giống hoa, cây cảnh triển vọng khác. Các giống hoa này đều sinh trưởng, phát triển khỏe, chất lượng cao hơn hẳn các giống phổ biến ngoài sản xuất, hiệu quả thu được gấp 1,5 - 2 lần giống đối chứng đang phổ biến ngoài sản xuất, góp phần quan trọng, bổ sung vào cơ cấu giống hoa của Việt Nam.

(Mô hình sản xuất hoa Lan Hồ Điệp quy mô công nghiệp)

Song song với việc tạo giống mới, Viện Nghiên cứu Rau quả cũng xây dựng được hơn 30 quy trình kỹ thuật nhân giống, quy trình kỹ thuật trồng chăm sóc hoa thương phẩm: điển hình là quy trình sản xuất hoa lan Hồ Điệp quy mô công nghiệp (đã được tặng cúp vàng Techmart Việt Nam ASEAN +3, quy trình sản xuất lan Hồ Điệp này đang được chuyển giao áp dụng cho 11 tỉnh, thành trong cả nước, góp phần đưa công nghệ sản xuất hoa ở Việt Nam tiếp cận với các nước trong khu vực); Quy trình sản xuất hoa lily áp dụng cho các tỉnh phía Bắc, giúp cho miền Bắc Việt Nam từ chỗ không sản xuất được hoa lily đến nay quy mô sản xuất đã đạt trên 10 triệu củ (cây)/năm, chất lượng tương đương các vùng trồng hoa lớn, có điều kiện tốt như Đà Lạt – Lâm Đồng, Côn Minh (Trung Quốc); Quy trình điều khiển hoa cúc ra hoa đúng thời điểm…Các Quy trình trên đã và đang được chuyển giao ứng dụng cho hơn 40 tỉnh, thành trên cả nước, góp phần đáng kể vào sự nghiệp nghiên cứu, phát triển sản xuất hoa, cây cảnh ở Việt Nam

Trong giai đoạn tới, dựa trên những kết quả và kinh nghiệm đạt được, Viện Nghiên cứu Rau quả tiếp tục đặt ra những nhiệm vụ mới, quyết tâm đưa ngành công nghiệp hoa Việt Nam vươn ra thế giới, bắt kịp và sánh ngang các nước trong khu vực, châu lục và trên thế giới.